محمد یزدی، دبیر جامعه مدرسین حوزه علمیه قم، در نامه‌ای سرگشاده‌ به آیت‌الله موسی شبیری زنجانی، مرجع تقلید شیعه، به دیدار او با محمد خاتمی و تعداد دیگری از چهره‌های اصلاح‌طلب اعتراض کرده است. محسن کدیور، استاد مطالعات دینی دانشگاه دوک، درباره دلایل نوشتن این نامه از سوی یزدی می‌گوید: